Démonstrations logicielles

Les démonstrations logicielles ont lieu dans l'amphithéâtre, parallèlement aux sessions posters. Chaque présentation dure 5 minutes.

Lundi 30 juin, 15h55-16h40

• Heliquest, a web server to screen sequences with alpha-helix related properties. Romain Gautier, Dominique Douguet, Bruno Antonny and Guillaume Drin.
• Docking@GRID, plateforme Web dédiée au Docking moléculaire par approches multi-objectives. N. Melab, L. Jourdan, J-C Boisson, A-A Tantar, A. Liefooghe, G. Even, T. Legrand, C. Canape, B. Parent, S. Avi, L. Brillet, L. Lafanachère, S. Roy, D. Horvath and E-G Talbi.
• Odegat, automatic re-alignment and standardization of one-dimensional electrophoretic profiles. Romain Daveau, Paul Morel, Danièle Gilbert, Vincent Goëb, Marlène L'Otellier, François Tron, Olivier Vittecoq and Jacques van Helden.
• OxyGene, an innovative platform to investigate oxidative-response genes in prokaryotes whole genomes. David Thybert, Stéphane Avner, Céline Lucchetti-Miganeh, Angélique Chéron and Frédérique Barloy-Hubler

Mardi 1 juillet, 10h25-11h10

• gnpIS, the plant information system of INRA URGI bioinformatics platform. Delphine Steinbach, Michael Alaux , Erik Kimmel, Sophie Durand, Cyril Pommier, Isabelle Luyten, Nacer Mohellibi, Daphné Verdelet, Isabelle Lenfle-Blanc, Sébastien Reboux and Hadi Quesneville.
• gnpSNp, the URGI polymorphism database dedicated to plants. Nacer Mohellibi, Fabienne Granier, Delphine Steinbach, Erik Kimmel, Cyril Pommier, Dominique Brunel and Hadi Quesneville.
• gnpGENOME, the URGI genomic annotation database based on GMOD tools. Michael Alaux, Isabelle Blanc-Lenfle, Cyril Pommier, Joelle Amselem, Isabelle Luyten, Delphine Steinbachand Hadi Quesneville.
• CATdb, les données de transcriptome à l'URGV. Jean Philippe Tamby, Séverine Gagnot, Marie-Laure Martin-Magniette, Philippe Grevet, Sébastien Aubourg, Jean Pierre Renou, Alain Lecharny and Véronique Brunaud.
• iMOMI, a database and a set of tools for the microbiologists. Nicolas Pons, Pierre Renault, Benjamin Candelon and Jean-Michel Batto.
• Selectome, a database of positive selection. Estelle Proux, Romain Studer, Sébastien Moretti and Marc Robinson-Rechavi.

Mardi 1 juillet, 15h55-16h40

• Autograph, un serveur web de génomique comparative multi-espèces. Thomas Derrien, Catherine André, Elaine Ostrander, Francis Galibert and Christophe Hitte.
• Insygt, a multi-genes multi-genomes browser that highlights synteny conservation in prokaryotes. Thomas Lacroix, Valentin Loux, Annie Gendrault, Mark Hoebeke and Jean-Francois Gibrat.
• Magnolia, multiple alignment of protein-coding and structural RNA sequences. Arnaud Fontaine, Antoine de Monte and Hélène Touzet.
• TEdenovo, a pipeline for the denovo identification of transposable elements in eukaryotic genomes. Timothée Flutre and Elodie Duprat.
• RNAmutants, efficient algorithms for probing the RNA mutation landscape.Jerome Waldispühl, Srinivas Devadas, Bonnie Berger, Peter Clote.

Mercredi 2 juillet, 10h40-11h20

• InteroPorc, an automatic tool to predict highly conserved protein interaction networks.Magali Michaut, Samuel Kerrien, Luisa Montecchi-Palazzi, Franck Chauvat, Corinne Cassier-Chauvat, Jean-Christophe Aude, Pierre Legrain and Henning Hermjakob.
• MABSys, modelization and analysis of biological systems. François Lemaire and Asli Urguplu.
• Mobyle, présentation du portail de bio-informatique. Nicolas Joly , Catherine Letondal , Corrine Maufrais , Hervé Ménager , Bertrand Néron and Pierre Tufféry.
• ATGC, plate-forme montpelliéraine: évolution, phylogénie, génomique comparative et fonctionnelle. V. Guignon, V. Lefort, K. Belkhir, J.-F. Dufayard, N. Galtier, O. Gascuel.