2012 - 2014

Université de Rouen Site web

Master 2 en BioInformatique en alternance (2ans)

Mention Très Bien

2011 - 2012

Université de Rouen Site web

Master 1 en BioInformatique

Mention Bien

2010 - 2011

Université Libanaise Site web

Master 1 biologie animale

Mention Bien

2007 - 2010

Université Libanaise Site web

License en biologie

Mention Bien

2014 - présent

Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille (CRIStAL) Site web et Centre de Recherche Jean Pierre Aubert (JPArc) Site web

Thèse en BioInformatique

Titre : Caractérisation des erreurs de séquençage non aléatoires, application aux mosaïques et tumeurs hétérogènes

Mots clés : motifs, cancer, NGS, variants génomiques, diagnostic, algorithmique de texte

2012 - 2014

Institut de Recherche sur le Cancer de Lille (IRCL) Site web

Chercheur et développeur en BioInformatique

Titre : Etude des motifs répétés au niveau des erreurs de séquençage HD et dévéloppement d'une base de données pour les données issues du séquençage Haut-Débit à visée diagnostique

Mots clés : motifs, cancer, Ruby On Rails, NGS, variants génomiques, diagnostic, base de données

Mars - Juin 2012

Laboratoire DC2N-Inserm U982 Site web en collaboration avec LITIS/TIBS A4108 Site web et LMRS-CNRS Site web

Chercheur BioInformaticien

Titre : Recherche et développement algorithmique d'un outil BioInformatique pour l'identification et l'annotation des cibles de miARNs

Mots clés : Perl, R, HTML, CGI, prediction des cibles, algorithmique

Informatique
Bureautique MS Office, OpenOffice, LATEX
Programmation Java, C, Perl, Bash, R, Ruby, Git
Langages Web HTML, CSS, Javascript, Ruby On Rails
Bases de données MySQL, PostGreSQL
Systèmes Linux, Windows
Algorithmique Alignement multiple des séquences, structures de données (arbres, graphes,...), combinatoire des mots

BioStatistique
Statistique exploratoire Classification supervisée/non supervisée, analyse en composante principale
Stat Array Analyse de données transcriptomiques, modèles statistiques, normalisation, analyses différentielles
Statistique inférentielle statistiques descriptives, estimation, tests statistiques

Biologie
Cours théoriques Immunologie, Cancérologie, biochimie, biologie et génétique moléculaire, biologie cellulaire, microbiologie, virologie, physiologie, signalisation,...
Bio-analyse Utilisation des banques de données internationales (NCBI, EBI,...), comparaison de séquences et alignement multiple, traitement des données NGS et recherche des variants
  1. 1. Saad C, Ferry G, Vergne N, Bérard C, Anouad Y, Lecroq T and Dubessy C. miRabel : a web tool for miRNA target prediction (article en cours de rédaction)

  2. 2. Marceau-Renaut, Alice and Renneville, Aline and Nibourel, Olivier and Jardin-Mathé, Olivia and Demay, Christophe and Villenet, Céline and Geffroy, Sandrine and Helevaut, Nathalie and Quief, Sabine and Saad, Chadi and others, Le séquençage de nouvelle génération (NGS) at-il déjà sa place dans nos laboratoires d’oncohématologie? Hématologie 19, 112-122 (2013).

  1. 1. GC-VC/DGE: a user-friendly web application for Going over Concordance across results from NGS bioinformatics analytic pipelines (poster pour ECCB’14 )

  2. 2. Diagnosis Variants Database : présentation dans le séminaire d’animation de l’axe 1 du Cancéropôle Nord-Ouest qui s’est déroulée le 6 Décembre 2013 à Rouen (France).

  3. 3. J’ai assisté aux ”Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM)” qui se sont déroulées du 1 au 4 Juillet 2013 à Toulouse (France).

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